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Zotero + Obsidian + Codex 联动教程:搭建个人知识库实操教程

工具准备​

这套流程主要用到三个工具。​

Zotero:按照目录和标签管理论文 PDF;​

Obsidian:保存精读笔记、模板、索引页和素材;​

Codex:读取 Zotero 中的论文,按照 Obsidian 中编写的模板生成笔记,再基于 Obsidian 中的笔记回答问题。​

初步设置 Obsidian 仓库​

(1) 先在 Obsidian 里新建一个仓库,比如叫 Research Board。 然后建几个文件夹:​

notes:放精读后的论文笔记;​

templates:放精读模板;​

indexs:放论文索引页。​

(2) 在 templates 里新建一个精读模板 paper-template.md,后面 Codex 精读论文时就按会这个模板来写。​

精读模板可以根据自己的阅读习惯整理,这里我举个例子:​

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飞书文档 - 图片

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整理 Zotero 的论文​

Zotero 这边主要做两件事:​

上传文献;​

利用文件夹和标签管理文献。​

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这里不建议把所有论文都堆在一个文件夹里。后面让 Codex 批量处理时,文件夹越清楚,指定范围就越方便。​

设置 Codex​

(1) 打开 Codex,进入 Obsidian 仓库所在的文件夹。忘记仓库位置也没关系,Obsidian 左下可以查看路径。​

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(2) 然后安装两个相关 Skills:​

Zotero Analytical Workflow Skills: 用来从 Zotero 里读取论文并生成精读笔记。​

Research Board Literature Retrieval Skill: 用来检索 Obsidian 中已经整理好的论文笔记,并基于这些笔记回答问题。​

这一步完成后,Zotero、Obsidian 和 Codex 就连起来了。​

精读论文​

(1) 批量精读 Zotero 整个目录中的论文,可以告诉 Codex 目录名,Codex 会自动按模板处理并整理到 Obsidian 对应目录中:​

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(2) 也可以精读某篇论文,告诉 Codex :​

请处理 Zotero 中 “[目录名]” 目录下的论文 “[DPF名称]”。​

安装 Obsidian 插件 Dataview​

Dataview 可以读取每篇笔记开头的属性并且创建索引页,形成你的科研知识库。​

(1) 在设置中的第三方插件中搜索 Dataview;​

(2) 找到后安装,点击启用。​

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基于知识库提问​

(1) 等 notes 里有了一批结构比较统一的笔记,就可以让 Codex 基于这些内容回答问题。这里我举个例子,当然也可以问的更具体一点。​

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(2) 等某个方向积累到一定数量,再让 Codex 基于 notes 做主题总结、方法比较或相关工作提纲。​

总结​

以前用 Zotero 只是存论文,存完怎么用基本靠标签和脑子记。​

现在把 Zotero、Obsidian 和 Codex 串起来之后,读过的每篇论文都能变成以后可以直接调用的素材,阅读本身也成了一个持续积累的过程。​

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